《条例》对外国船舶及其人员，进入海南管辖海域不得有违反沿海边防治安管理的行为进行了界定，包括：通过海南管辖领海海域时非法停船或者下锚，寻衅滋事；未经查验准许擅自出境入境或者未经批准擅自改变出境入境口岸；非法登上海南管辖岛屿；破坏海南管辖岛屿上的海防设施或者生产生活设施；实施侵犯国家主权或者危害国家安全的宣传活动和其他法律、法规规定违反沿海边防治安管理的行为。
《条例》规定，外国船舶及其人员有以上规定情形之一的，公安边防机关可以依法采取登临，检查，扣押，驱逐，令其停航、改航、返航等措施予以处置，可以收缴作案船舶或者附属通航设备等工具，并依照《中华人民共和国治安处罚管理法》、《中华人民共和国出境入境管理法》等有关法律、法规追究其法律责任。
同时，为鼓励海南邮轮、游艇业的发展，《条例》规定，对邮轮、游艇以及近海作业渔船等船舶，可以减免边防签证手续，具体范围由海南省公安边防机关确定并向社会公布，“船员以外的人员出海，应当持有居民身份证、护照、港澳台通行证等有效身份证件，接受公安边防机关检查和管理。”
